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RNA Pull-down 实验服务
随着高通量测序技术的发展,越来越多的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)被注释出来,RNA pull-down作为研究RNA与蛋白互作的核心技术,已成为研究焦点。蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。
RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA相互作用的主要技术之一,是近年来研究IncRNA、circRNA与蛋白质相互作用的主要手段。其原理是是使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与细胞或组织的提取液进行孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成份分离。复合物洗脱后,通过WB实验检测特定的蛋白是否与RNA相互作用,或者运用质谱筛选RNA结合的未知蛋白。
服务优势
高特异性:富集与特定RNA序列相互作用的蛋白质,具有高度的特异性。
高灵敏度:能够检测低丰度的RNA结合蛋白质,提供高灵敏度的检测能力。
广泛适用性:可用于研究各种RNA结合蛋白质,包括转录因子、RNA结合蛋白和翻译调控因子等。
可定量分析:通过引入外源标记或荧光标记的RNA探针,可以定量测量RNA与蛋白质的结合强度。
联合应用:可与其他技术相结合,如质谱分析、蛋白质组学方法和转录组学方法等,进一步深入研究RNA-蛋白质相互作用的功能和调控网络。
RNA-Pull down 服务流程
RNA Pull-down 服务内容
服务内容 | 周期 | 交付 | 价格 |
1、制备正义链反义链探针 | 2周 | 1、检测质谱图 2、实验报告 3、所有原始数据及图片 | 询价 |
2、RNA pull down | 2周 | ||
3、Western blot | 1周 | ||
4、LC-MS | 2周 |
RNA Pull-down 检测服务样品要求
样品类型 | 样品需求 | 保存条件 | 运输条件 | 备注 |
动物组织 | 1、单个样品>2g,EP管或冻存管装。 2、样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低。 3、冻存样本避免反复冻融以致降解。 | -80℃ | 干冰 | 所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识 |
种子样本 | 去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 | |
贴壁/悬浮细胞 | 细胞至少5*107个/份,常温离心(1000-1500 rpm,5 min),常温离心收集细胞。贴壁细胞用胰蛋白酶消化后,吹打收集,PBS洗涤细胞,去除多余培养基和胰蛋白酶。开盖液氮速冻15 min,-80℃保存。 | -80℃ | 干冰 | |
核蛋白 | 每组量100ug,最少做五组,正义链实验组对照组,反义链实验组对照组,磁珠蛋白组,总蛋白量要500ug以上 | -80℃ | 干冰 |