技术服务


RNA Pull-down 实验服务

随着高通量测序技术的发展,越来越多的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)被注释出来,RNA pull-down作为研究RNA与蛋白互作的核心技术,已成为研究焦点。蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。

RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA相互作用的主要技术之一,是近年来研究IncRNA、circRNA与蛋白质相互作用的主要手段。其原理是是使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与细胞或组织的提取液进行孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成份分离。复合物洗脱后,通过WB实验检测特定的蛋白是否与RNA相互作用,或者运用质谱筛选RNA结合的未知蛋白。


服务优势

高特异性:富集与特定RNA序列相互作用的蛋白质,具有高度的特异性。

高灵敏度:能够检测低丰度的RNA结合蛋白质,提供高灵敏度的检测能力。

广泛适用性:可用于研究各种RNA结合蛋白质,包括转录因子、RNA结合蛋白和翻译调控因子等。

可定量分析:通过引入外源标记或荧光标记的RNA探针,可以定量测量RNA与蛋白质的结合强度。

联合应用:可与其他技术相结合,如质谱分析、蛋白质组学方法和转录组学方法等,进一步深入研究RNA-蛋白质相互作用的功能和调控网络。


RNA Pull-down 服务流程


RNA Pull-down服务流程.jpg


RNA Pull-down 服务内容


服务内容

周期

交付

价格

1、制备正义链反义链探针

2周

1、检测质谱图

2、实验报告

3、所有原始数据及图片

询价

2、RNA pull down

2周

3、Western blot

1周

4、LC-MS

2周

 

RNA Pull-down 检测服务样品要求


样品类型

样品需求

保存条件

运输条件

备注

动物组织

1、单个样品>2g,EP管或冻存管装。

2、样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低。

3、冻存样本避免反复冻融以致降解。

-80℃

干冰

所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识

种子样本

去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。

-80℃

干冰

贴壁/悬浮细胞

细胞至少5*107个/份,常温离心(1000-1500 rpm,5 min),常温离心收集细胞。贴壁细胞用胰蛋白酶消化后,吹打收集,PBS洗涤细胞,去除多余培养基和胰蛋白酶。开盖液氮速冻15 min,-80℃保存。

-80℃

干冰

核蛋白

每组量100ug,最少做五组,正义链实验组对照组,反义链实验组对照组,磁珠蛋白组,总蛋白量要500ug以上

-80℃

干冰

 




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